On je uložio žalbu na suspenziju FIFA od 10 utakmica zbog skandiranja "Za dom spremni“ posle meča sa Islandom. To se dogodilo nakon što se reprezentacija Hrvatske kvalifikovala za šampionat sveta izbacivši Island u baražu. Čak je Šimunićev advokat pre dve nedelje uveravao kako će Josip sigurno igrati na SP u Brazilu, ali je na kraju razum pobedio i SPORTski sud za arbitražu nije imao ni jedan razlog da promeni presudu FIFA.
Šimunić je uz suspenziju dobio i zabranu pristupa stadionima tokom šampionata sveta. FIFA je Šimunića optužila za širenje mržnje, a njegov potez je okarakterisan kao fašistički.
Šimunić je tako veorvatno završio reprezentativnu karijeru sa 105 nastupa.
