FIFA je 13. juna, na zahtev etičkog tužioca Mihaela Garsije, suspendovala Bekenbauera na 90 dana iz fudbala, jer Nemac nije želeo da sarađuje u istrazi o eventualnoj korupciji u kandidaturi za domaćine svetskih prvenstava 2018. i 2022. godine.
Šef njegovg menadžmenta Markus Hefl rekao je da ukidanje suspenzije momentalno stupa na snagu, ali da Bekenbauer neće putovati na Svetsko prvenstvo u Brazil. Bekenbauer je bio član Izvršnog odbora FIFA koji je 2010. godine izabrao Katar i Rusiju za domaćine Svetskog prvenstva 2018. i 2022.
U fudbalskoj diplomatiji počeo je da radi kada je postao predsednik organizacionog odbora Svetskog prvenstva u Nemačkoj 2006. godine. Od 2007. do 2011. bio je član Izvršnog odbora FIFA. Franc Bekenbauer je bio prvak i kao igrač, 1974. u Nemačkoj, i kao selektor nemačke reprezentacije – 1990. u Italiji.
